Como instalar o disulfinder no Ubuntu 21.04

Comando de instalação rápida

Para os que têm pressa, aqui está um comando de instalação de uma linha:

sudo apt-get update && sudo apt -y install disulfinder

Mas se estiver interessado nos passos detalhados com descrições, os seguintes A informação é para si.

O que é disulfinder e como o instalar?

Antes de iniciar este tutorial, necessitará de acesso a um servidor ou computador a correr Ubuntu 21.04. Isto guia foi escrito especificamente com um servidor a correr Ubuntu 21.04 em mente, embora deve também funcionar em versões mais antigas e suportadas do sistema operativo.

Além disso, certifique-se também de que está a executar um utilizador regular, não-root com sudo privilégios configurados no seu servidor. Quando tiver uma conta disponível, inicie sessão como utilizador não root para começar.

Há várias maneiras de instalar disulfinder em Ubuntu 21.04. Pode utilizar (os links podem ser clicados):

Nas secções seguintes, descreveremos cada método em pormenor. Pode escolher um deles ou referir-se ao recomendado.

Instalar disulfinder usando apt-get

Primeiro, actualizar a base de dados apt com apt-get usando o seguinte comando.

sudo apt-get update

Depois de actualizar a base de dados apt-get, Pode instalar disulfinder usando apt, executando o seguinte comando:

sudo apt -y install disulfinder

Instalar disulfinder usando apt

Porque disulfinder está disponível por defeito em Ubuntu 21.04 repositórios, é possível instalá-lo a partir destes repositórios utilizando o sistema de embalagem apt.

Para começar, actualizar a base de dados apt com apt usando o seguinte comando.

sudo apt update

After updating apt database, Pode instalar disulfinder usando apt executando o seguinte comando: After updating apt database,

sudo apt -y install disulfinder

Instalar disulfinder usando aptitude

Se quiser seguir este método, poderá ter de instalar primeiro a aptidão, uma vez que A aptidão não é normalmente instalada por defeito em Ubuntu 21.04. Actualizar a base de dados apt com aptitude usando o seguinte comando.

sudo aptitude update

After updating apt database, Pode instalar disulfinder usando apt executando o seguinte comando: After updating apt database,

sudo aptitude -y install disulfinder

Como actualizar um único pacote disulfinder usando apt-get?

First, you will need to update packages index. Executar o comando update como habitualmente:

sudo apt-get update

A seguir, para actualizar apenas o disulfinder, por exemplo, pacote único, deve usar o seguinte formato com o comando apt-get/apt:

sudo apt-get --only-upgrade install disulfinder

Note que este comando não instalará quaisquer novos pacotes! Se deseja instalar o comando pacote se este não existir pode deixar de fora --only-upgrade parte.

sudo apt-get install disulfinder

Como Desinstalar disulfinder de Ubuntu 21.04

Para desinstalar apenas o disulfinder pacote que pode executar o seguindo o comando:

sudo apt-get remove disulfinder

Desinstalar disulfinder e todas as suas dependências

Para desinstalar disulfinder e as suas dependências que já não são necessários por Ubuntu 21.04, pode usar o comando abaixo:

sudo apt-get -y autoremove disulfinder

Remover disulfinder com todas as configurações e dados

Para remover a configuração e dados disulfinder do seu sistema, pode executar o seguinte comando purge:

sudo apt-get -y purge disulfinder

Remover completamente disulfinder (configurações, dados e todos os seus dependências)

E por último, pode executar o comando seguinte para remover absolutamente tudo relacionado com disulfinder pacote, por exemplo: configurações, dados e todas as suas dependências. Basta usar este comando:

sudo apt-get -y autoremove --purge disulfinder

Informação extra e exemplos de código

'dissullfinder' é para prever o estado de ligação dissulfeto dos cisteínas e sua conectividade de dissulfeto a partir apenas da sequência. As pontes de dissulfeto desempenham um papel importante na estabilização do processo de dobra para várias proteínas. A previsão de pontes de dissulfeto somente da sequência é útil para o estudo de propriedades estruturais e funcionais de proteínas específicas. Além disso, o conhecimento sobre o estado de ligação de dissulfetos de cisteínas pode ajudar o processo de determinação da estrutura experimental e pode ser útil em outras tarefas de anotação genômica. 'dissulfetor' prevê padrões de dissulfeto em dois estágios computacionais: (1) o estado de ligação dissulfeto de cada cisteína é previsto por um classificador binário BRNN-SVM; (2) cisteínas que são conhecidas por participar na formação de pontes são emparelhadas por uma Rede Neural Recursiva para obter um padrão de conectividade.

Conclusão

Tem agora um guia completo sobre como instalar disulfinder usando ferramentas apt, apt-get e aptitude. Também mostramos como actualizar como um único pacote e diferentes formas de desinstalar o disulfinder de Ubuntu 21.04.

Veja também: