Como instalar o disulfinder no CentOS 8

Comando de instalação rápida

Se você só está interessado no comando de instalação, aqui está uma resposta rápida para você:

sudo yum makecache && sudo yum -y install disulfinder

sudo dnf makecache && sudo dnf -y install disulfinder

Mas se você estiver interessado nos detalhes com instruções passo a passo, as seguintes informações será útil.

O que é disulfinder e Como instalá-lo?

Primeiramente, você precisará ter acesso a um servidor ou computador em execução CentOS 8. Este guia foi escrito especificamente com um servidor rodando CentOS 8 em mente, embora também deve funcionar em versões mais antigas e suportadas do sistema operacional.

Além disso, certifique-se de que você está executando um usuário regular, não root com sudo privilégios configurados em seu servidor. Quando você tiver uma conta disponível, faça o login como seu usuário não-roteiro para começar.

Há várias maneiras de instalar disulfinder em CentOS 8. Você pode usar (os links podem ser clicados):

Nas seções seguintes, descreveremos cada método em detalhes. Você pode escolher um deles ou referir-se ao recomendado.

Instalar disulfinder em CentOS 8 usando dnf

Primeiro, atualize o banco de dados de pacotes dnf com dnf, e xecutando o próximo comando:

sudo dnf makecache --refresh

Após a atualização do banco de dados, Você pode instalar disulfinder usando dnf, executando o seguinte comando:

sudo dnf -y install disulfinder

Instalar disulfinder em CentOS 8 usando yum

Porque o disulfinder está disponível no CentOS 8 padrão a partir desses repositórios, é possível instalá-los usando a embalagem yum sistema.

Para começar, atualizar o banco de dados de pacotes locais com yum usando o seguinte comando.

sudo yum makecache --refresh

Agora pode instalar o pacote disulfinder em seu servidor/computador executando o seguinte comando:

sudo yum -y install disulfinder

Como atualizar um único pacote disulfinder usando yum?

Para atualizar tudo os pacotes disponíveis no sistema:

yum update

Se você deseja atualizar um pacote específico como disulfinder neste exemplo você deve usar o seguinte comando:

yum update disulfinder

Para rebaixar um pacote para uma versão anterior:

yum downgrade disulfinder

Como fazer o upgrade disulfinder em CentOS 8 com dnf?

Quando você executa o dnf update, todos os pacotes do sistema com atualizações disponíveis são atualizados. Entretanto, se você quiser atualizar um único pacote, então você teria que passar o nome do pacote como o argumento para o comando dnf update.

dnf update disulfinder

Como remover / desinstalar disulfinder do CentOS 8

Para desinstalar somente o disulfinder pacote que você pode executar o seguindo o comando:

sudo dnf remove disulfinder

Informações extras e exemplos de códigos

'dissullfinder' é para prever o estado de ligação dissulfeto dos cisteínas e sua conectividade de dissulfeto a partir apenas da sequência. As pontes de dissulfeto desempenham um papel importante na estabilização do processo de dobra para várias proteínas. A previsão de pontes de dissulfeto somente da sequência é útil para o estudo de propriedades estruturais e funcionais de proteínas específicas. Além disso, o conhecimento sobre o estado de ligação de dissulfetos de cisteínas pode ajudar o processo de determinação da estrutura experimental e pode ser útil em outras tarefas de anotação genômica. 'dissulfetor' prevê padrões de dissulfeto em dois estágios computacionais: (1) o estado de ligação dissulfeto de cada cisteína é previsto por um classificador binário BRNN-SVM; (2) cisteínas que são conhecidas por participar na formação de pontes são emparelhadas por uma Rede Neural Recursiva para obter um padrão de conectividade.

Conclusão

Agora você tem um guia completo sobre como instalar o disulfinder usando os gerentes de pacotes dnf e yum. Além disso, mostramos como atualizar manualmente como um único pacote e diferentes maneiras de desinstalar o disulfinder de CentOS 8.

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