Cómo instalar evec2pca en Ubuntu 22.04

Comando de instalación de una línea

Para los que tienen prisa, he aquí un comando de instalación de una sola línea:

sudo apt-get update && sudo apt -y install eigensoft

Pero si está interesado en los pasos detallados con descripciones, la siguiente información es para usted.

Qué es evec2pca y cuáles son las formas de instalarlo?

Antes de comenzar este tutorial, necesitará acceder a un servidor o a un ordenador que ejecute Ubuntu 22.04. Esta guía guía fue escrita específicamente con un servidor que ejecuta Ubuntu 22.04 en mente, aunque aunque también debería funcionar en versiones anteriores del sistema operativo.

Además, asegúrese de que está ejecutando un usuario normal, no root, con privilegios sudo configurado en su servidor. Cuando tenga una cuenta disponible, inicie sesión como su usuario no root para comenzar.

Hay varias formas de instalar evec2pca en Ubuntu 22.04. Puedes utilizar (los enlaces son clicables):

En las siguientes secciones, describiremos cada método en detalle. Puede elegir uno de ellos o consultar el recomendado.

Instalar evec2pca usando apt-get

Primero, actualice la base de datos apt con apt-get usando el siguiente comando.

sudo apt-get update

Después de actualizar la base de datos apt-get, puede instalar evec2pca utilizando apt ejecutando el siguiente comando:

sudo apt -y install eigensoft

Instalar evec2pca usando apt

Porque evec2pca está disponible en los repositorios, es posible instalarlo desde estos repositorios utilizando el sistema de empaquetado apt.

Para empezar, actualice la base de datos apt con apt utilizando el siguiente comando.

sudo apt update

Después de actualizar la base de datos apt, puede instalar evec2pca utilizando apt ejecutando el siguiente comando:

sudo apt -y install eigensoft

Instalar evec2pca usando aptitude

Si quiere seguir este método, es posible que tenga que instalar aptitude primero ya que aptitude no suele estar instalado por defecto en Ubuntu 22.04. Actualice la base de datos de apt con aptitude utilizando el siguiente comando.

sudo aptitude update

Después de actualizar la base de datos de aptitude, Puedes instalar evec2pca ejecutando el siguiente comando:

sudo aptitude -y install eigensoft

Cómo actualizar un solo paquete paquete evec2pca usando apt-get?

En primer lugar, tendrá que actualizar el índice de paquetes. Ejecute el comando update como de costumbre:

sudo apt-get update

A continuación, para actualizar sólo el evec2pca, por ejemplo, un solo paquete, debe utilizar el siguiente formato con el comando apt-get/apt:

sudo apt-get --only-upgrade install eigensoft

Note that this command will not install any new packages! Si desea instalar el paquete si no existe, puede omitir la parte de --only-upgrade.

sudo apt-get install eigensoft

Cómo desinstalar evec2pca de Ubuntu 22.04

Para desinstalar sólo el paquete evec2pca se puede ejecutar el siguiente comando:

sudo apt-get remove eigensoft

Desinstalar evec2pca y todas sus dependencias

Para desinstalar evec2pca y sus dependencias que ya no son necesarias para Ubuntu 22.04, puedes utilizar el siguiente comando:

sudo apt-get -y autoremove eigensoft

Eliminar evec2pca con todas las configuraciones y datos

Para eliminar la configuración y los datos de evec2pca de su sistema puede ejecutar el siguiente comando purge:

sudo apt-get -y purge eigensoft

Eliminar completamente evec2pca (configuraciones, datos y todas sus dependencias)

Y por último, puedes ejecutar el siguiente comando para eliminar absolutamente todo relacionado con el paquete evec2pca, por ejemplo: configuraciones, datos y todas sus dependencias. Sólo tienes que utilizar este comando:

sudo apt-get -y autoremove --purge eigensoft

Información adicional y ejemplos de código

El paquete EIGENSOFT combina la funcionalidad de los métodos de genética de poblaciones del grupo (Patterson et al. 2006) y su método de estratificación EIGENSTRAT (Price et al. 2006). El método EIGENSTRAT utiliza el análisis de componentes principales para modelar explícitamente las diferencias de ascendencia entre casos y controles a lo largo de ejes continuos de variación; la corrección resultante es específica de la variación de frecuencia de un marcador candidato entre poblaciones ancestrales, minimizando las asociaciones espurias al tiempo que maximiza el poder para detectar asociaciones verdaderas. El paquete EIGENSOFT tiene un script de trazado incorporado y admite múltiples formatos de archivo y fenotipos cuantitativos.

Conclusión

Ahora tienes una guía completa sobre cómo instalar evec2pca using apt, apt-get and aptitude tools. Además, mostramos cómo actualizar como un solo paquete y diferentes formas de desinstalar el evec2pca de Ubuntu 22.04.

Ver también: