Cómo instalar evec2pca en CentOS 8

Comando de instalación de una sola línea

Si sólo te interesa el comando de instalación, aquí tienes una respuesta rápida para ti:

sudo yum makecache && sudo yum -y install eigensoft

sudo dnf makecache && sudo dnf -y install eigensoft

Pero si le interesan los detalles con instrucciones paso a paso, la siguiente información le será útil.

Qué es evec2pca y cómo se instala?

Lo primero es lo primero, necesitarás acceso a un servidor o a un ordenador que ejecute CentOS 8. Esta guía guía fue escrita específicamente con un servidor que ejecuta CentOS 8 en mente, aunque aunque también debería funcionar en versiones anteriores del sistema operativo.

Además, asegúrese de que está ejecutando un usuario normal, no root, con privilegios sudo configurado en su servidor. Cuando tenga una cuenta disponible, inicie sesión como su usuario no root para comenzar.

Hay varias formas de instalar evec2pca en CentOS 8. Puedes utilizar (los enlaces son clicables):

En las siguientes secciones, describiremos cada método en detalle. Puede elegir uno de ellos o consultar el recomendado.

Instalar evec2pca en CentOS 8 usando dnf

Primero, actualice la base de datos de paquetes dnf con dnf ejecutando el siguiente comando:

sudo dnf makecache --refresh

Después de actualizar la base de datos, puede instalar evec2pca usando dnf ejecutando el following command:

sudo dnf -y install eigensoft

Instalar evec2pca en CentOS 8 usando yum

Dado que evec2pca está disponible en los repositorios por defecto de CentOS 8, es posible instalarlo desde estos repositorios utilizando el sistema de empaquetado yum.

Para empezar, actualice la base de datos de paquetes locales con yum utilizando el siguiente comando.

sudo yum makecache --refresh

Ahora puede instalar el paquete evec2pca en su servidor/ordenador ejecutando el siguiente comando:

sudo yum -y install eigensoft

Cómo actualizar un solo paquete paquete evec2pca usando yum?

Para actualizar todos los paquetes disponibles en el sistema:

yum update

Si desea actualizar un paquete específico como evec2pca en este ejemplo debe utilizar el siguiente comando:

yum update eigensoft

Para degradar un paquete a una versión anterior:

yum downgrade eigensoft

Cómo actualizar evec2pca en CentOS 8 con dnf?

Cuando se ejecuta el dnf update, se actualizan todos los paquetes del sistema con actualizaciones disponibles. Sin embargo, si desea actualizar un solo paquete, entonces tendría que pasar el nombre del paquete como el argumento al comando dnf update.

dnf update eigensoft

Cómo eliminar evec2pca de CentOS 8

Para desinstalar sólo el paquete evec2pca se puede ejecutar el siguiente comando:

sudo dnf remove eigensoft

Información adicional y ejemplos de código

El paquete EIGENSOFT combina la funcionalidad de los métodos de genética de poblaciones del grupo (Patterson et al. 2006) y su método de estratificación EIGENSTRAT (Price et al. 2006). El método EIGENSTRAT utiliza el análisis de componentes principales para modelar explícitamente las diferencias de ascendencia entre casos y controles a lo largo de ejes continuos de variación; la corrección resultante es específica de la variación de frecuencia de un marcador candidato entre poblaciones ancestrales, minimizando las asociaciones espurias al tiempo que maximiza el poder para detectar asociaciones verdaderas. El paquete EIGENSOFT tiene un script de trazado incorporado y admite múltiples formatos de archivo y fenotipos cuantitativos.

Conclusion

Ahora tienes una guía completa sobre cómo instalar evec2pca usando los gestores de paquetes dnf y yum. Además, mostramos cómo actualizar manualmente como un solo paquete y diferentes formas de desinstalar el evec2pca de CentOS 8.

Ver también: