Cómo instalar disulfinder en Ubuntu 21.04

Comando de instalación de una línea

Para los que tienen prisa, he aquí un comando de instalación de una sola línea:

sudo apt-get update && sudo apt -y install disulfinder

Pero si está interesado en los pasos detallados con descripciones, la siguiente información es para usted.

Qué es disulfinder y cuáles son las formas de instalarlo?

Antes de comenzar este tutorial, necesitará acceder a un servidor o a un ordenador que ejecute Ubuntu 21.04. Esta guía guía fue escrita específicamente con un servidor que ejecuta Ubuntu 21.04 en mente, aunque aunque también debería funcionar en versiones anteriores del sistema operativo.

Además, asegúrese de que está ejecutando un usuario normal, no root, con privilegios sudo configurado en su servidor. Cuando tenga una cuenta disponible, inicie sesión como su usuario no root para comenzar.

Hay varias formas de instalar disulfinder en Ubuntu 21.04. Puedes utilizar (los enlaces son clicables):

En las siguientes secciones, describiremos cada método en detalle. Puede elegir uno de ellos o consultar el recomendado.

Instalar disulfinder usando apt-get

Primero, actualice la base de datos apt con apt-get usando el siguiente comando.

sudo apt-get update

Después de actualizar la base de datos apt-get, puede instalar disulfinder utilizando apt ejecutando el siguiente comando:

sudo apt -y install disulfinder

Instalar disulfinder usando apt

Porque disulfinder está disponible en los repositorios, es posible instalarlo desde estos repositorios utilizando el sistema de empaquetado apt.

Para empezar, actualice la base de datos apt con apt utilizando el siguiente comando.

sudo apt update

Después de actualizar la base de datos apt, puede instalar disulfinder utilizando apt ejecutando el siguiente comando:

sudo apt -y install disulfinder

Instalar disulfinder usando aptitude

Si quiere seguir este método, es posible que tenga que instalar aptitude primero ya que aptitude no suele estar instalado por defecto en Ubuntu 21.04. Actualice la base de datos de apt con aptitude utilizando el siguiente comando.

sudo aptitude update

Después de actualizar la base de datos de aptitude, Puedes instalar disulfinder ejecutando el siguiente comando:

sudo aptitude -y install disulfinder

Cómo actualizar un solo paquete paquete disulfinder usando apt-get?

En primer lugar, tendrá que actualizar el índice de paquetes. Ejecute el comando update como de costumbre:

sudo apt-get update

A continuación, para actualizar sólo el disulfinder, por ejemplo, un solo paquete, debe utilizar el siguiente formato con el comando apt-get/apt:

sudo apt-get --only-upgrade install disulfinder

Note that this command will not install any new packages! Si desea instalar el paquete si no existe, puede omitir la parte de --only-upgrade.

sudo apt-get install disulfinder

Cómo desinstalar disulfinder de Ubuntu 21.04

Para desinstalar sólo el paquete disulfinder se puede ejecutar el siguiente comando:

sudo apt-get remove disulfinder

Desinstalar disulfinder y todas sus dependencias

Para desinstalar disulfinder y sus dependencias que ya no son necesarias para Ubuntu 21.04, puedes utilizar el siguiente comando:

sudo apt-get -y autoremove disulfinder

Eliminar disulfinder con todas las configuraciones y datos

Para eliminar la configuración y los datos de disulfinder de su sistema puede ejecutar el siguiente comando purge:

sudo apt-get -y purge disulfinder

Eliminar completamente disulfinder (configuraciones, datos y todas sus dependencias)

Y por último, puedes ejecutar el siguiente comando para eliminar absolutamente todo relacionado con el paquete disulfinder, por ejemplo: configuraciones, datos y todas sus dependencias. Sólo tienes que utilizar este comando:

sudo apt-get -y autoremove --purge disulfinder

Información adicional y ejemplos de código

'disulfinder' es para predecir el estado de unión de disulfuro de las cisteínas y su conectividad disulfuro a partir de la secuencia sola. Los puentes disulfuro juegan un papel importante en la estabilización del proceso de plegamiento de varias proteínas. Por lo tanto, la predicción de puentes disulfuro a partir de la secuencia sola es útil para el estudio de las propiedades estructurales y funcionales de proteínas específicas. Además, el conocimiento sobre el estado de unión de disulfuro de las cisteínas puede ayudar al proceso de determinación de la estructura experimental y puede ser útil en otras tareas de anotación genómica. 'disulfinder' predice los patrones de disulfuro en dos etapas computacionales: (1) el estado de enlace disulfuro de cada cisteína es predicho por un clasificador binario BRNN-SVM; (2) las cisteínas que se sabe que participan en la formación de puentes son emparejadas por una red neuronal recursiva para obtener un patrón de conectividad.

Conclusión

Ahora tienes una guía completa sobre cómo instalar disulfinder using apt, apt-get and aptitude tools. Además, mostramos cómo actualizar como un solo paquete y diferentes formas de desinstalar el disulfinder de Ubuntu 21.04.

Ver también: