Cómo instalar disulfinder en CentOS 8

Comando de instalación de una sola línea

Si sólo te interesa el comando de instalación, aquí tienes una respuesta rápida para ti:

sudo yum makecache && sudo yum -y install disulfinder

sudo dnf makecache && sudo dnf -y install disulfinder

Pero si le interesan los detalles con instrucciones paso a paso, la siguiente información le será útil.

Qué es disulfinder y cómo se instala?

Lo primero es lo primero, necesitarás acceso a un servidor o a un ordenador que ejecute CentOS 8. Esta guía guía fue escrita específicamente con un servidor que ejecuta CentOS 8 en mente, aunque aunque también debería funcionar en versiones anteriores del sistema operativo.

Además, asegúrese de que está ejecutando un usuario normal, no root, con privilegios sudo configurado en su servidor. Cuando tenga una cuenta disponible, inicie sesión como su usuario no root para comenzar.

Hay varias formas de instalar disulfinder en CentOS 8. Puedes utilizar (los enlaces son clicables):

En las siguientes secciones, describiremos cada método en detalle. Puede elegir uno de ellos o consultar el recomendado.

Instalar disulfinder en CentOS 8 usando dnf

Primero, actualice la base de datos de paquetes dnf con dnf ejecutando el siguiente comando:

sudo dnf makecache --refresh

Después de actualizar la base de datos, puede instalar disulfinder usando dnf ejecutando el following command:

sudo dnf -y install disulfinder

Instalar disulfinder en CentOS 8 usando yum

Dado que disulfinder está disponible en los repositorios por defecto de CentOS 8, es posible instalarlo desde estos repositorios utilizando el sistema de empaquetado yum.

Para empezar, actualice la base de datos de paquetes locales con yum utilizando el siguiente comando.

sudo yum makecache --refresh

Ahora puede instalar el paquete disulfinder en su servidor/ordenador ejecutando el siguiente comando:

sudo yum -y install disulfinder

Cómo actualizar un solo paquete paquete disulfinder usando yum?

Para actualizar todos los paquetes disponibles en el sistema:

yum update

Si desea actualizar un paquete específico como disulfinder en este ejemplo debe utilizar el siguiente comando:

yum update disulfinder

Para degradar un paquete a una versión anterior:

yum downgrade disulfinder

Cómo actualizar disulfinder en CentOS 8 con dnf?

Cuando se ejecuta el dnf update, se actualizan todos los paquetes del sistema con actualizaciones disponibles. Sin embargo, si desea actualizar un solo paquete, entonces tendría que pasar el nombre del paquete como el argumento al comando dnf update.

dnf update disulfinder

Cómo eliminar disulfinder de CentOS 8

Para desinstalar sólo el paquete disulfinder se puede ejecutar el siguiente comando:

sudo dnf remove disulfinder

Información adicional y ejemplos de código

'disulfinder' es para predecir el estado de unión de disulfuro de las cisteínas y su conectividad disulfuro a partir de la secuencia sola. Los puentes disulfuro juegan un papel importante en la estabilización del proceso de plegamiento de varias proteínas. Por lo tanto, la predicción de puentes disulfuro a partir de la secuencia sola es útil para el estudio de las propiedades estructurales y funcionales de proteínas específicas. Además, el conocimiento sobre el estado de unión de disulfuro de las cisteínas puede ayudar al proceso de determinación de la estructura experimental y puede ser útil en otras tareas de anotación genómica. 'disulfinder' predice los patrones de disulfuro en dos etapas computacionales: (1) el estado de enlace disulfuro de cada cisteína es predicho por un clasificador binario BRNN-SVM; (2) las cisteínas que se sabe que participan en la formación de puentes son emparejadas por una red neuronal recursiva para obtener un patrón de conectividad.

Conclusion

Ahora tienes una guía completa sobre cómo instalar disulfinder usando los gestores de paquetes dnf y yum. Además, mostramos cómo actualizar manualmente como un solo paquete y diferentes formas de desinstalar el disulfinder de CentOS 8.

Ver también: